Ставропольская СДЮШОР по гандболу была открыта Постановлением Ставропольского краевого Совета ВДФСО профсоюзов в 1989 году, в целях дальнейшего развития и популяризации гандбола в Ставропольском крае. Директором школы был назначен В.Г.Лавров, исполняющий обязанности по настоящее время.
В 1992 году СДЮШОР по гандболу получила название СДЮШОР ФСО профсоюзов «Россиия». С 1 января 2003 года школа получила государственный статус и наименование Государственное образовательное учреждение дополнительного образования детей Ставропольского края специализированная детско-юношеская спортивная школа олимпийского резерва по гандболу (ГОУ ДОД СК СДЮСШОР по гандболу). В настоящее время школа входит в состав Ставропольских городских учреждений и с 2010 по 2019 года носила название МБОУ ДОД ДЮСШОР по гандболу города Ставрополя.
С 1 октября 2019 года переименовано в Муниципальное бюджетное учреждение спортивная школа олимпийского резерва по гандболу города Ставрополя (МБУ СШОР по гандболу города Ставрополя)
Учебные занятия в школе проводятся в соответствии с учебной программой в группах начальной подготовки, учебно-тренировочных группах, группах спортивного совершенствования и группах высшего спортивного мастерства. Среднее количество учащихся в школе ежегодно составляет 500 человек.